5 automatizovaný karyotypovací softvér na mapovanie vašich chromozómov

Karyotypizácia je proces usporiadania a spárovania všetkých chromozómov nachádzajúcich sa v organizme, aby sa získal komplexný pohľad na celú mapu chromozómov jedinca.

Najprv sa však najprv uistite, že na prvom mieste sú chromozómy. Chromozómy sú štruktúry, ktoré vyzerajú podobne ako vlákna, ktoré sú obsiahnuté v jadre každej bunky vášho tela.

Každá chromozómová štruktúra obsahuje celý genetický informačný plán vášho tela. To určuje spôsob, akým je vaše telo štruktúrované, reaguje na podnety, predispozíciu k chorobám atď. Ženy majú 2 chromozómy X a muži majú jeden chromozóm X a jeden chromozóm Y. Každá bunka vášho tela obsahuje 23 párov chromozómov, celkom 46 chromozómov.

Aby vedci boli schopní pochopiť sekvencie chromozómov každého pacienta, používajú karyotypovací softvér . Tento typ softvéru je určený na vykonávanie analýzy chromozómov a vyhodnocuje štruktúru a počet chromozómov osoby. Týmto spôsobom môžu výskumníci a vedci odhaliť abnormality.

V tomto článku budeme skúmať niektoré skvelé softvérové možnosti, ktoré vám umožnia vykonať analýzu karyotypovania.

Top 5 automatizovaných nástrojov na použitie karyotypingu v roku 2019

ArgusSoft

ArgusSoft je skvelá softvérová možnosť, ktorá vám umožní automaticky karyotypovať ľudské chromozómy podľa pozície kapely, a môže byť tiež použitý na karyotypovanie zvierat a chromozómov rastlín online.

Kľúčové vlastnosti:

Farbenie G, Q, R
Automatizované karyotypovanie ľudských chromozómov s rozpoznaním ohybov
Automatizované karyotypovanie chromozómov ošípaných
3 zabudované základy štandardných ideogramov ľudských chromozómov s rôznymi úrovňami jasnosti - 400, 550 a 850 úrovní
Môžu pridať bázy štandardných cromozómových ideogramov pre iné druhy zvierat a rastlín
Metódy prípravy vzoriek
Vstup obrázkov z metafázovej platne pomocou kamery a skenera
Sprievodný obrázok s grafikou
Automatizované rozdelenie aplikovaných a kontaktných chromozómov
Porovnanie chromozómov a ideogramov

Môžete tiež použiť ArgusSoft na trénovanie systému rozpoznávania chromozómov pomocou prednastavených prípravkov, môžete prenášať obrazy metafázových platní a karyogramy v zabudovanej databáze, vytvárať vzory správ, opravovať karyogramy a ukladať a tlačiť obrázky a výsledky analýz.

Môžete získať školenia a podporu pre používanie ArgusSoft z ich oficiálnych stránok. Podporné centrum zahŕňa školenia, údržbu a poradenské služby.

Skúste ArgusSoft

HiBand pomocou aplikovaného spektrálneho zobrazovania

HiBand je softvér vytvorený pomocou aplikácie Applied Spectral Imaging, ktorý môže vykonávať pokročilú analýzu chromozómov pomocou funkcií digitálneho karyotypovania. Tento softvér

využíva funkcie automatizovaného skenovania pre hĺbkovú analýzu štruktúry chromozómov.

Na indexovanie, počítanie, ukladanie a správu údajov o výsledkoch môžete použiť širokú škálu funkcií, ktoré sa nachádzajú v systéme HiBand. Tento výkonný softvér môžete tiež použiť na automatické skenovanie sekvencie chromozómov.

Výsledky získané pomocou nájdených karyotypových funkcií HiBand môžu byť uložené na bezpečnom mieste s vrstvami chránenými heslom a šifrovanými vrstvami. To vám umožňuje pokojnú dušu, pokiaľ ide o stratu dôležitých sekvenčných údajov, a preto zlepšuje aj efektívnosť laboratória.

Triedenie podľa výsledkov sa robí veľmi jednoduchým spôsobom, stačí len vyhľadať špecifickú sekvenciu chromozómov a všetky výsledky sa zobrazia na dobre zobrazenej obrazovke, ktorá ponúka ľahký prístup na úpravu, kontrolu a pridávanie značiek do všetkých súborov.

Kľúčové vlastnosti:

Brightfield Karyotyping-G-Band a R-Band
Fluorescencia Karyotyping-Q-Band, R-Band a FISH
Spektrálne karyotypovanie
Automatické počítanie chromozómov
Indexovanie a klasifikácia chromozómov
Pokročilá separácia chromozómov a pokročilé vylepšenie obrazu
Galéria obrázkov - dokáže prezentovať všetky prípadové metafázy a karyotypy na jednej obrazovke
Môže porovnávať chromozómy - pozri ich vedľa seba
Abberant Ideogram - do generátora obrázkov môžete pridať chromozómy, bunky, ideogramy a anotácie

HiBand využíva plne automatizované pracovné postupy pre zvýšenie efektivity laboratórií, má funkcie „start-and-walk-away“, nájde metafázy, automaticky prečíta čiarové kódy, nahrá obrázky v reálnom čase počas skenovania snímok a tiež exportuje do laboratória LIS Central Portal a database.

Skúste HiBand

Ikaros od MetaSystems

Tento karyotypovací systém má veľmi intuitívne užívateľské rozhranie, ktoré ponúka všetky funkcie na jednej obrazovke. To umožňuje jednoduchý a rýchly prístup ku všetkým získaným informáciám.

Ikaros môže byť použitý s Neon, čo je platforma, ktorá má pomôcť s obrazovými údajmi a organizáciou prípadu. Neon zhromažďuje údaje zo všetkých zobrazovacích úloh, externých zdrojov a umožňuje vám ich prezentovať v ľahko pochopiteľnom spôsobe pomocou panela správy prípadov.

Tento nástroj vám umožní mať vždy k dispozícii dôležité informácie a bezpečne ich uchovávať, ale používa veľmi silné algoritmy na správu údajov, má pekný rozsah spôsobov, ako pozorovať údaje a poskytovať špecifické vyhľadávania na základe kľúčových slov a údajov.

Viac informácií o Neone a jeho funkciách nájdete tu .

Ikaros podporuje mnoho rôznych techník spájania - Brightfield G-Band a R-Band, Fluorescencia Q-Band, R-Band a FISH - ponúka veľký počet preddefinovaných karyogramových foriem pre ľudí, rastliny a zvieratá. Tieto formuláre môžete ľahko upraviť tak, aby ste pridali všetky údaje potrebné pre daný typ výskumu.

Skutočnosť, že môžete porovnávať chromozómy podľa triedy alebo karyogramov, vám ponúka veľmi užitočné informácie, ktoré vám umožňujú ľahko identifikovať rozdiely.

Vyskúšajte Ikaros

MetaClass podľa Microptic

MetaClass je skvelý karyotyoping softvér, ktorý je navrhnutý modulárne. Tento softvér vám pomôže vykonávať karyotypovanie a FISH štúdie chromozómov.

MetaClass je tvorený z nasledujúcich modulov:

Databáza MetaClass

Databáza, ktorá môže byť nainštalovaná s niektorým z modulov MetaClass. Umožňuje ukladať podrobnosti o pacientovi a poskytuje jednoduchý prístup k výsledkom. Pomocou tohto modulu môžete vytvárať prispôsobené prehľady v ľubovoľnom jazyku.

MetaClass Karyotyping

Umožňuje študovať karyotyp po digitalizácii snímok štádia prípravy metafázy a usporiadať ich do párov na základe veľkosti, pozície atď. Tento modul vám poskytuje vynikajúce výsledky kvality, pokiaľ ide o pásy chromozómov, a môže tiež vám poskytnú profesionálne vyzerajúce správy.

Medzi kľúčové funkcie patrí:

Štúdia karyotypu sa analyzuje pri svetelnom 100-násobnom zväčšení
Dokáže zachytiť niekoľko metafázových obrazov
Kvalita obrazu je upraviteľná pre ostrejšie výsledky
Automatická klasifikácia chromozómov
4 zobrazenia na obrazovke - Metafáza, Karyotyp a okno Nezaradené chromozómy
Môže zobrazovať chromozómové prototypy
Chromozómy, ktoré nie sú klasifikované, môžu byť automaticky alebo manuálne opravené - superpozície, separácia, kríženia, rotácie atď.
Súbory MTC relácií alebo obrázky BMP možno kedykoľvek uložiť a znova načítať
Dokáže exportovať jednotlivé chromozómy do databázy Metaclass s možnosťou pridávať komentáre a poznámky

Tu je príklad správy karyotypovania Metaclass.

MetaClass FISH

Toto je analytický modul, ktorý vám umožní získať Fluorescent IN SITU hybridizáciu (FISH). Tento modul zachytáva snímky pomocou fluorescenčných sond DNA a umožňuje potvrdiť genetické abnormality - trisomie, mocrodelections, chromozómové preskupenia, atď.

Snímky FISH sa analyzujú pri 100-násobnom zväčšení a pre širší rozsah čistoty obrazu môžu tiež snímať snímky s rôznymi filtrami.

Ak máte záujem dozvedieť sa viac informácií o moduloch uvedených vyššie a ďalších funkciách, môžete si prezrieť katalóg MetaClass.

Ak ste zvedavý typ a chcete vidieť správu získanú pomocou metódy FISH, môžete

vzorový súbor PDF.

Skúste MetaClass

Genasis Bandview

GenASis Bandview je ďalší skvelý karyotypovací softvér, ktorý je vytvorený z modulov s rôznymi capabitilites. Túto aplikáciu môžete použiť na vykonanie diagnostiky karyotypovania a získanie presných výsledkov testov.

Tento softvér vám umožňuje plne prispôsobiť pracovný postup a proces diagnostiky v závislosti od potrieb vašej spoločnosti a cieľov, ktoré sa snažíte dosiahnuť.

Široká škála nástrojov, ktoré poskytuje BandView, je ľahko dostupná jediným kliknutím myši a ponúka výkonný zážitok karyotypovania G / R / C / Q-Band. Môžete si vybrať medzi automatizovaným alebo manuálnym pracovným tokom, pokiaľ ide o lokalizáciu metafáz a zachytávanie snímok.

Ak sa zistia abnormality chromozómov, možno ich pozorovať pridaním, deléciou alebo preskupením genetického materiálu pacienta. S BandView môžete použiť pásmo molekulárnej techniky FISH.

FISH využíva fluorescenčné sondy na pripojenie k rôznym častiam chromozómu, čo umožňuje softvéru detekovať a lokalizovať abnormity nachádzajúce sa v špecifických sekvenciách DNA.

Vyskúšajte GenASis Bandview

záver

V tomto článku sme skúmali niektoré z najlepších automatizovaných karyotypovacích programov, ktoré existujú na trhu koncom roka 2018.

Možnosti softvéru karyotypovania uvedené v tomto článku ponúkajú rôzne funkcie, ktoré vám pomôžu dosiahnuť ciele vašej spoločnosti.

Pomocou tohto typu softvéru môžete rýchlo počítať tisíce štruktúr chromozómov, analyzovať ich pomocou rôznych profesionálnych techník a vytvárať vysoko kvalitné správy, ktoré vám umožnia ľahko identifikovať všetky abnormality.

Radi by sme zistili, aký je váš názor na softvér, ktorý sme prezentovali v tomto top 5 zozname. Prosím, neváhajte a dajte nám vedieť pomocou sekcie komentárov nižšie.

SÚVISIACE PORADENSTVO, KTORÉ POTREBUJETE KONTROLA: